虫草的保质期一般是2-3年，如果在真空条件下可以存放5年，但是随着时间的流失，虫草里面的有效成分也会慢慢流失。同时，虫草越新鲜质量越好，最好不要放的时间比较长。
一般通过正常的干燥方法处理后，可以增长虫草的保存时间。
可以将虫草放在通风的环境下，这样是不会变质发霉的，如果太潮湿，用密封袋包装后保存在冰箱内保鲜层就可以了，冰箱温度应控制在-1-5摄氏度。
也可以将虫草与花椒或丹皮同放在密封的玻璃瓶中，放在冰箱保鲜层中冷藏，这样就可以随用随取。花椒所散发的气味有杀虫除菌的功效，可以包装保存。
如果发现受潮后，应立即晾晒。在阳光明媚的时候，把散装虫草撒放在阳光充足的地面上晒干，之后轻轻地把虫草捡起，装入塑料薄膜袋子中后密封，放于阴凉干燥处保存就可以了。
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