1、品种不同
泥鳅属于鳅科，其中夏季最多，泥鳅捕捉后，可鲜用或烘干用。可食用、入药，而黄鳝属合鳃鱼目，外形像缩小版的蛇，所以也叫蛇鱼、长鱼等。
2、体型不同
泥鳅身长较短，尾部侧扁，整个呈马蹄形，口须5对，尾鳍则呈圆形，鳞片细小，一般喜欢待在泥下，背部和背侧呈灰黑色，并伴有黑色小斑点，鱼肚成白色或浅黄色，而身形细长呈蛇形，前面的体型偏圆而后侧扁平，尾巴又尖又细，头长而圆。
3、功效不同
泥鳅性平、味甘，具有补中益气、祛湿止泻、除湿退黄、暖脾胃的功效，而黄鳝可以温阳健脾、补气养血、祛风通络。
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