1、调查讯问。对于涉及严重职务违法的人员，可以个人陈述，也可用讯问的方式，要求其供述违法行为。在调查过程中，监察人员也可以通过询问、查询、调取的方式调查。
2、留置。案件重大复杂，被调查人有可能发生逃跑、自杀、串供等情况或者其他规定情形，就可能被采取留置措施。留置的最长期限是三个月，并且可以延长一次。
3、如果是在其他犯罪中发现有重大职务违法嫌疑的，也是以检察机关为主调查。
4、立案，通知家属和公布社会。通过调查发现严重违法行为涉及犯罪，需要追究刑事责任的，监察机关将启动立案程序。立案后会及时通知家属，并且通过网站发布等形式向社会公布。
5、监察机关的处理。立案之后，并不一定移送起诉，监察机关将根据严重违法的程度，作出行政处分、问责等处理决定，情节特别轻的也可以批评教育或者诫勉谈话。构成犯罪的严重职务违法行为，会进入刑事诉讼程序，通过检察院追究刑事责任。
6、复审和复核。对于监察机关作出的决定，严重职务违法行为人可以要求复审，复审的时效是受到决定一个月之内，监察机关在一个月内作出复审决定；对复审不服的，可以向上一级监察机关申请复核，复核决定会在二个月之内作出。原决定确实有错误的，可以纠正。
7、值得注意的是，复审、复核期间，原来的决定还是要执行的。
8、检察院审查。案件到检察院阶段，已经进入刑事诉讼程序，检察机关通过审查，根据证据的情况，可以做出起诉、补充调查和不起诉的决定。需要起诉的出庭公诉；证据不足的补充证据；不够罪的作不起诉决定。
9、法院审判。案件事实清楚，符合起诉条件的，检察院会在规定的时间内，作出起诉决定。法院根据事实和证据，做出有罪或者无罪判决。法院判决后，可以按照审判程序进行上诉或者申诉。
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